通常所说的血液配型指红细胞血型，分为A型、B型、O型、AB型四种情况，一般输血前都要做供体和患者的红细胞血型比对。而造血干细胞移植所说的配型，其实是指人体白细胞上面的一种特殊的识别系统--人类白细胞抗原(HLA)，这与人体的免疫系统密切相关，如果供体和受体的HLA兼容性很差，那么移植到体内的干细胞就会被患者本身的免疫系统攻击，从而导致移植失败。
因此，移植前最关键的就是看供体和受体的HLA是否匹配。
在寻找配型时，要稳定患者的病情，最好处于疾病缓解的状态，此时没有出现感染等并发症，也没有严重的合并症，比如心脏病等，这样能够让患者获得最大的治愈机会。
同时，要寻找匹配的造血干细胞，遵循优中选优的原则。
2.如果没有全相合的，就可以从有血缘关系的亲属中寻找具有半相合的造血干细胞;
3.或者从骨髓库中寻找没有血缘关系，但是匹配度比较高的骨髓造血干细胞或者脐带血干细胞。
当患者病情稳定了，同时也找到了合适的骨髓，就可以安排病人进行移植了，患者需要进入无菌病房，也称为净化仓，实际上就是一种空气被过滤的无菌病房。
进到无菌病房后，需要用多种药物进行预处理，想办法把患者体内异常的骨髓造血干细胞清理掉，相当于给即将移植进来的造血干细胞挪出位置。
清理掉体内异常的骨髓造血干细胞后，将供体的造血干细胞像输血一样，输到患者体内。
造血干细胞有个特点--归巢功能，就是输到患者外周血液中的干细胞，会自动地通过循环系统，回归到骨髓之中，重建患者的骨髓造血功能，这个归巢的过程大概需要两周。
待植入的造血干细胞在患者体内成功造血，产生了红细胞、白细胞、血小板等血细胞后，就说明移植成功了，也称为植活。
植活后，还要进行移植后的处理，比如使用免疫抑制剂。而且，患者的造血功能重建后，免疫系统会逐渐重建，但是一般需要一年甚至更久，在这期间有一个敏感期，复发率较高，重点就是预防感染，避免去公共场所，尽量待在比较干净的环境里。
干细胞移植患者在预处理后造血重建之前有一段无髓期，在这段时间里患者的白细胞、血小板都会降到极低的程度。在这段无髓期里患者极易发生各种形式的感染，感染可以发生在呼吸道、消化道等多个部位，可以由病毒、细菌、真菌等多种病原体引起;血小板减少使生理止血活动低下，容易发生自发性出血。尤其是颅内出血，往往危及生命。因此在无髓期，应密切观察血常规变化，一旦出现白细胞、血小板的降低，应紧急给与处理，包括输注血小板、使用抗生素、刺激因子刺激造血。由于预处理中采用大剂量的化疗药物，这些化疗药物基本都对人体有损伤，根据损伤靶器官不同有不同的表现，最常见的是肝肾功能的损伤，严重的可以引起肝衰、肾衰。
晚期并发症
部分化疗药物和预处理是全身照射可以损伤晶状体、生殖系统、内分泌系统，导致白内障、不育、生长发育障碍;大部分预处理药物都有致突变作用，有引起继发其他肿瘤的可能。
特殊并发症
移植物抗宿主病(GVHD)：是由于供受者之间HLA不一致所引起的供体免疫细胞攻击受者的现象，分为急性和慢性两种情况。
急性移植物抗宿主病通常发生在移植后1个月之内，主要有皮疹、黄疸、腹泻三大表现，轻症患者可仅表现为面积大小不等的皮疹，严重的可出现全身黄疸，大量水样腹泻，肠粘膜坏死，危及生命。GVHD的严重程度在临床上分为四级，一般GVHD出现的越早、表现越重，往往提示预后不佳，尤其是爆发性的GVHD死亡率极高。在治疗过程中预防GVHD的常用药物包括CsA、MTX、皮质激素，GVHD一旦发生可采用皮质激素冲击、增加CsA等方法控制。
慢性GVHD通常发生在移植后6个月左右，多继发于急性GVHD，也有部分患者没有急性GVHD病史。90％以上慢性GVHD患者都有皮肤受损，可表现为硬皮病样改变和苔藓样变，此外还有眼部干涩、黄疸等表现。胃肠道症状较急性GVHD少见。慢性GVHD的主要治疗手段也是CsA+皮质激素。控制急性GVHD能显著慢性GVHD的发生。
肝静脉闭塞病(VOD)
造血干细胞移植后严重的肝脏并发症，通常发生在造血干细胞回输后15天内。主要表现黄疸、肝区疼痛、腹水或者不明原因的体重增加，一旦发生死亡率超过40％。本病应早期发现早期治疗，常用预防药物为丹参、前列腺素E1、肝素。
出血性膀胱炎
出血性膀胱炎也是造血干细胞移植的常见并发症，干细胞移植早期的出血性膀胱炎多与预处理治疗中的大剂量环磷酰胺引起，在预处理前后给与大量补液、碱化尿液，适当利尿，并且使用化疗保护剂美司纳可以显著降低这种出血性膀胱炎的发生;后期的出血性膀胱炎多为病毒感染，主要也是对症支持治疗，部分重症患者前列腺素有一定疗效。
